Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM3

Nkx2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-4Q9EQM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-4Q9EQM3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-4Q9EQM3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-4Q9EQM3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-4Q9EQM3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nkx2-4Q9EQM3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-4Q9EQM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-4Q9EQM3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms