Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MNCb-2875Q9DCB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MNCb-2875Q9DCB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms