Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpne8Q9DC53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne8Q9DC53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms