Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrpraQ9DBG7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrpraQ9DBG7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms