Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Alkbh4Q9D8F1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alkbh4Q9D8F1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms