Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl4Q9D8E6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl4Q9D8E6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms