Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fip1l1Q9D824 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fip1l1Q9D824 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms