Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c55Q9D816 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms