Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan17Q9D7W4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan17Q9D7W4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan17Q9D7W4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms