Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmigd1Q9D7L8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms