Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D7E4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D7E4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D7E4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D7E4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D7E4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D7E4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D7E4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D7E4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms