Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf225Q9D7D1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf225Q9D7D1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms