Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MsraQ9D6Y7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MsraQ9D6Y7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MsraQ9D6Y7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms