Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc3Q9D6Y1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc3Q9D6Y1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms