Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip1Q9D620 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip1Q9D620 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms