Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnbd2Q9D5U8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnbd2Q9D5U8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnbd2Q9D5U8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnbd2Q9D5U8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnbd2Q9D5U8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnbd2Q9D5U8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms