Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D5Q8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9D5Q8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D5Q8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms