Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp6v1e2Q9D593 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms