Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930513O06RikQ9D549 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930513O06RikQ9D549 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930513O06RikQ9D549 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms