Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D4W2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D4W2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D4W2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D4W2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D4W2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D4W2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Q9D4W2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D4W2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms