Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf6Q9D4J7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf6Q9D4J7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms