Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efhd1Q9D4J1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efhd1Q9D4J1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms