Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc6Q9D4E6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms