Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D2Q3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D2Q3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9D2Q3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms