Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spns3Q9D232 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spns3Q9D232 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spns3Q9D232 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spns3Q9D232 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spns3Q9D232 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spns3Q9D232 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spns3Q9D232 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spns3Q9D232 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spns3Q9D232 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms