Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Exo5Q9CXP9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exo5Q9CXP9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms