Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem50aQ9CXL1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem50aQ9CXL1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem50aQ9CXL1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms