Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkrip1Q9CWV6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prkrip1Q9CWV6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Prkrip1Q9CWV6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms