Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930553M12RikQ9CUH1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms