Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sft2d3Q9CSV6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms