Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CactinQ9CS00 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CactinQ9CS00 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CactinQ9CS00 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CactinQ9CS00 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CactinQ9CS00 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CactinQ9CS00 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CactinQ9CS00 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CactinQ9CS00 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms