Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc96Q9CR92 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc96Q9CR92 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc96Q9CR92 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms