Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gadd45gip1Q9CR59 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45gip1Q9CR59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45gip1Q9CR59 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms