Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg12Q9CQY1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg12Q9CQY1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg12Q9CQY1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms