Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Nicn1Q9CQM0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Nicn1Q9CQM0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Nicn1Q9CQM0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Nicn1Q9CQM0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nicn1Q9CQM0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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Nicn1Q9CQM0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Nicn1Q9CQM0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Nicn1Q9CQM0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Nicn1Q9CQM0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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