Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms