Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pkp2Q9CQ73 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp2Q9CQ73 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp2Q9CQ73 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp2Q9CQ73 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms