Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2a1Q99PM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2a1Q99PM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms