Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rrbp1Q99PL5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rrbp1Q99PL5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rrbp1Q99PL5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Rrbp1Q99PL5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rrbp1Q99PL5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 343.4 ms