Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rtn4Q99P72 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms