Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntnap4Q99P47 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntnap4Q99P47 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms