Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bco2Q99NF1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bco2Q99NF1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bco2Q99NF1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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