Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tdrd1Q99MV1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd1Q99MV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd1Q99MV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd1Q99MV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms