Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a9Q99MR3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a9Q99MR3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms