Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tm2d1Q99MB3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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