Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprtQ99M80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprtQ99M80 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprtQ99M80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
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