Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms