Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlcd1Q99JT6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlcd1Q99JT6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlcd1Q99JT6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlcd1Q99JT6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlcd1Q99JT6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlcd1Q99JT6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlcd1Q99JT6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tlcd1Q99JT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlcd1Q99JT6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms