Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb6Q922F4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubb6Q922F4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubb6Q922F4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms