Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mthfd1Q922D8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mthfd1Q922D8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms